Das Zollkommissariat Dresden ist operative Kernzelle zur 24/7-Sicherung sämtlicher vollzugspolizeilichen Aufgaben des Zolls in seinem Bezirk. Es operiert in der Alltagslast weitestgehend selbstständig und verfügt über drei Zollwachen in Dresden, Dresden-Flughafen und Pirna, die 24/7 mit Kontroll- und Streifenkräften besetzt und einsatzfähig sind sowie über einen Kriminaldienst mit mehreren Kommissariaten in Dresden für die kriminalpolizeilichen Aufgaben des Zolls. Zudem sind in Dresden zwei Einsatzgruppen Intensivkontrolle (Mobile Großröntgentechnik) stationiert.