Das Zollkommissariat Darmstadt ist operative Kernzelle zur 24/7-Sicherung sämtlicher vollzugspolizeilichen Aufgaben des Zolls in seinem Bezirk. Es operiert in der Alltagslast weitestgehend selbstständig und verfügt über eine Zollwache in Darmstadt, die 24/7 mit Kontroll- und Streifenkräften besetzt und einsatzfähig ist sowie über einen Kriminaldienst mit mehreren Kommissariaten in Darmstadt und Hanau für die kriminalpolizeilichen Aufgaben des Zolls. Zudem sind in Darmstadt noch die zentralen Verstärkungskräfte in den Einsatzgruppen der mobilen Zollverstärkungskräfte, der Kontrollgruppe Technik, der Sicherungs-, Begleit- und Transportgruppe sowie der Tatortgruppe stationiert. Zollkriminalität wird vom Zollkommissariat Frankfurt am Main bearbeitet.