Das Zollkommissariat Bremen ist operative Kernzelle zur 24/7-Sicherung sämtlicher vollzugspolizeilichen Aufgaben des Zolls in seinem Bezirk. Es operiert in der Alltagslast weitestgehend selbstständig und verfügt über zwei Zollwachen in Bremen und Bremen-Flughafen, die 24/7 mit Kontroll- und Streifenkräften besetzt und einsatzfähig sind sowie über einen Kriminaldienst mit mehreren Kommissariaten in Bremen für die kriminalpolizeilichen Aufgaben des Zolls. Zudem sind in Bremen noch die zentralen Verstärkungskräfte in den Einsatzgruppen der mobilen Zollverstärkungskräfte, der Kontrollgruppe Technik, der Sicherungs-, Begleit- und Transportgruppe sowie der Tatortgruppe stationiert.