Das Zollkommissariat Landshut ist operative Kernzelle zur 24/7-Sicherung sämtlicher vollzugspolizeilichen Aufgaben des Zolls in seinem Bezirk. Es operiert in der Alltagslast weitestgehend selbstständig und verfügt über drei Zollwachen in Landshut, Passau und Plattling einschließlich Außenstelle Zwiesel, die 24/7 mit Kontroll- und Streifenkräften besetzt und einsatzfähig sind sowie über einen Kriminaldienst mit mehreren Kommissariaten in Landshut, Passau, Plattling und Pfarrkirchen für die kriminalpolizeilichen Aufgaben des Zolls.