Das Hauptzollamt Münster mit seinen Dienstsitzen in Münster und Bielefeld sichert die Einnahmen von Zöllen und Verbrauchssteuern.

Die Dienstsitze sind jeweils wie folgt unterteilt:

• Stabsstelle
• Zentrale Aufgaben, Organisation, Personal, Haushalt und IT
• Fachliche Behandlung
• Betriebsprüfung
• Strafsachen- und Bußgeldstelle / Ahndung
• Vollstreckung

Hinzu kommen die einzelnen Zollämter und Abfertigungsstellen:

• Münster
• Rheine
• Bocholt
• Coesfeld
• Münster-Flughafen
• Bielefeld
• Arnsberg
• Paderborn
• Lemgo
• Beckum
• Lübbecke
• Anröchte